目前頭目戰參與的方式是「等待頭目蛋孵化」、「孵化後有一小時聚集到道館並挑戰頭目」、「挑戰成功有機會捕捉」，更詳細的頭目戰規則請參考：寶可夢頭目戰怎麼打？詳細教學篇。頭目在孵化前，玩家只能看到各種顏色的蛋，這時哪種蛋適合等、哪種蛋又可以放棄呢？以下根據 Pokemongohub 整理出的列表給大家參考：
稀有頭目蛋（黃色）列表
黃色的蛋可以孵出水/雷/火精靈、風速狗、怪力、耿鬼、胡地、乘龍、御三家進化型、卡比獸、鐵甲暴龍（鑽角犀獸）、班吉拉等等。這些稀有等級的頭目是不大可能單挑處理的，建議找好隊友再進行戰鬥！
根據 Pokemongohub 的資料，這些稀有等級的寶可夢頭目需要至少 2 位玩家，或至少 5 位玩家參與戰鬥，否則打不贏。至於要如何捕捉頭目，請參考這篇教學：寶可夢頭目戰怎麼打？詳細教學篇
一般頭目蛋（粉紅色）列表
一般頭目比較弱，如果玩家夠強是有機會一對一單挑獲勝的。這些頭目包括了鯉魚王、藍鱷等御三家第二階段進化型、電擊獸、椰蛋樹、鴨嘴火龍、臭泥、雙彈瓦斯等等。
尚未開放的頭目蛋（傳說級）
之後將會有其他顏色的寶可夢頭目蛋，目前尚未開放，據信這些頭目蛋將會是傳說級寶可夢。詳情可見：如何取得傳說級寶可夢？傳說級頭目怎麼打？